В начале 1582 года казахские отряды Тауекель-султана приняли участие в походе Абдаллах-хана на Ташкент против Баба-султана и на овладение присырдарьинскими городами. Баба-султану под Ташкентом было нанесено сокрушительное поражение. Баба-султан бежал в ногайские степи, но решил вернуться. Об этом прознал Тауекель и у города Яссы разбил его отряд. Баба-султан был убит, обезглавлен. Его сын Латиф-султан и ближайшее окружение пленены. Всех пленных и голову Баба-султана Тауекель доставил Абдаллах-хану. Смерть Хакназар-хана была отомщена.
А Ташкент и все города по Сырдарье перешли под власть Абдаллаха. Казахам он не вернул ни одного города. Тауекель-султан получил от Абдаллаха богатые подарки и Африканетский вилает.
Вскоре, в том же 1582 году, умер Шигай-хан. Прослужив еще несколько месяцев, Тауекель порвал «клятвенный договор» с Абдаллахом и вернулся на родину. Здесь он выиграл долгую междоусобную борьбу с казахскими султанами и в 1586 году стал ханом казахского ханства. Он вернул ему полную независимую государственность и немедленно приступил к укреплению его могущества. К 1598 году имел уже хорошо вооруженное и обученное стотысячное войско.
Грандиозным был его замысел - присоединить к своему ханству все узбекские земли, весь Мавераннахр. Он установил дружеские связи с московским царем Федором Иоановичем, добивался военного союза против Абдаллаха и его союзника Кучум-хана. Военного союза не получилось, но события развивались благоприятно.
В первой половине 1598 года русские войска из сибирского города Тара нанесли окончательное поражение Кучум-хану, опасность его нападения с севера-востока в помошь Абдаллах-хану ликвидировалась. Сын Абдаллаха Абу аль Мумин неожиданно восстал против отца. Узнав об этом, Тауекель немедленно совершил набег на Ташкент и нанес высланному ему навстречу войску Абдаллаха жестокое поражение между Ташкентом и Самаркандом. И вернулся в свои степи. Абдаллах быстро снарядил новое войско, и, возглавив его лично, устремился за Тауекелем, но в походе внезапно умер. Во вспыхнувшей междуусобице был убит также Абу аль Мумин.
И тогда Тауекель-хан в августе 1598 года во главе своего стотысячного войска, взяв себе в помощники брата Есима, двинулся на завоевание Мавераннахра. В короткий срок были захвачены все присырдарьинские города, Ташкент, Самарканд, Андижан, Асхи и осаждена Бухара.
Но двенадцатисуточная ее осада завершилась внезапной мощной отчаянной вылазкой всего Бухарского гарнизона и поражением войска Тауекель-хана. Ему пришлось отступить. В ходе отступления он был тяжело ранен в ночном бою. Его довезли до Ташкента, где он скончался.
Казахским ханом стал брат Тауекеля Есим. По заключенному в 1599 году договору с новыми владетелями Бухары Аштраханидами, сменившими Шейбанидов, к Казахскому ханству были присоединены Ташкент, Фергана и все земледельческие районы Южного Казахстана с присырдарьинскими городами. Надолго, до Джунгарского нашествия.
Тауекель-султаном и другими казахскими султанами прибыл к Абдаллах-хану и принял вассальную от него зависимость, заключил с ним «клятвенный договор». Тауекель-султан с подчиненным ему войском поступил к Абдаллаху на службу и служил верно. Он отличался исключительной силой и отвагой. Значительная часть противников Абдаллах-хана была уничтожена с его участием, его руками.